Glycoside Hydrolase Family 28

Activities in FamilyXylogalacturonan hydrolase (EC 3.2.1.-);
Endo-polygalacturonase (EC 3.2.1.15);
Rhamnogalacturonase (EC 3.2.1.171);
Rhamnogalacturonan α-1,2-galacturonohydrolase (EC 3.2.1.173);
Galacturonan α-1,4-galacturonidase (EC 3.2.1.67);
Exo-poly-α-digalacturonosidase (EC 3.2.1.82);
Mechanism Inverting a
ClanGH-N
3D Structure Statusparallel β-helix
Catalytic Nucleophile/BaseAsp
Catalytic Proton DonorAsp
External resourcesCAZypedia; HOMSTRAD; PROSITE;
Commercial Enzyme Provider(s)MEGAZYME;
Statistics GenBank accession (18868); Uniprot accession (179); PDB accession (25); 3D entries (20); cryst (3)
| 1 | ... | 92 | 93 | 94 | 95 | 96 | 97 | 98 | 99 | 100 | ... | 101 |
Bacteria
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D
 BVV10_12450   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI99 AUJ01823.1    
 BVV10_03645   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI99 AUJ00543.1    
 EBA21_10790   Xanthomonas oryzae pv. oryzae NX0260 QBO04437.1    
 BRN32_14060   Xanthomonas oryzae pv. oryzae OS198 AXM15483.1    
 BRN51_09975   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX079 AXM42017.1    
 BRN52_10725   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX086 AXM34376.1    
 DZA55_08060   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO142 QBA14353.1    
 ATY43_09225   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO145 AOS08686.1    
 ATY44_09940   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO211 AOS12902.1    
 ATY45_09740   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO236 AOS17067.1    
 ATY46_13305   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO282 AOS21256.1    
 EBA22_13785   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO364 QBO06598.1    
 EBA23_13790   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO404 QBO10374.1    
 EBA24_13780   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO421 QBO14161.1    
 EBA25_13805   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO513 QBO17960.1    
 ATY47_13245   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO524 AOS25422.1    
 ATY48_13040   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO563 AOS29602.1    
 ATY49_13055   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO602 AOS33742.1    
 B9W05_08260   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK18822.1
AXI21946.1
QBO21797.1
   
 B9W05_15080 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK19820.1
AXI18958.1
AXI22944.1
   
 CDO19_08135   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AXI17111.1    
 ATY42_12965   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO71 AOS04628.1    
 APZ20_12220   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO83 ALZ74115.1    
 AZ54_10650   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 AJQ83010.1    
 AZ54_04090 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 AJQ81906.1    
 PXO_04250 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD57558.1    
 PXO_00376   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD58592.1    
 LA08_13785   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AXN21516.1    
 BO992_13215   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AZK85635.1    
 BXU03_10615   Xanthomonas oryzae pv. oryzae SK2-3 AXQ77366.1    
 EBA15_12510   Xanthomonas oryzae pv. oryzae T19 QBN79634.1    
 EBA15_03310   Xanthomonas oryzae pv. oryzae T19 QBN78285.1    
 EBA16_03305   Xanthomonas oryzae pv. oryzae Ug11 QBN81927.1    
 EBA16_12505   Xanthomonas oryzae pv. oryzae Ug11 QBN83280.1    
 ABM06_12980   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XF89b AQU47611.1    
 ABM06_13200   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XF89b AQU47616.1    
 B4599_20530 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XM9 AXX68702.1    
 B4599_13640   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XM9 AXX67685.1    
 BRN66_13580   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YC11 AXM17564.1    
 BO993_21155   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YN24 AZK89799.1    
 GHV42_18875 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola 0-9 QGH67361.1    
 GHV42_12445   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola 0-9 QGH66352.1    
 ACU13_11580   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola B8-12 AKN93578.1    
 XOC_2128   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 AEQ96274.1    
 ACU10_11525   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS279 AKN97309.1    
 ACU15_11315   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BXOR1 AKO00999.1    
 ACU11_09540   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP2286 AKO19665.1    
 ACU16_12315   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7331 AKO04800.1    
 ACU17_12130   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7341 AKO08682.1    
 BE73_10105   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 AJQ87400.1    
 BE73_20815 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 AJQ89209.1    
 BE73_20830 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 AJQ89212.1    
 V1208_11520   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GD06 WVN05105.1    
 XOCgx_2776   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 QEO97765.1    
 XOCgx_4225 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 QEO99212.1    
 K2I41_12550   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 UBB91721.1    
 K2I41_18990 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 UBB92724.1    
 HED68_18665 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX2019 WGY43980.1    
 HED68_12190   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX2019 WGY42981.1    
 ACU14_11525   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola L8 AKO12524.1    
 WMO35_09570   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola MD-Ivory-1-B WYL79241.1    
 H4J00_12065   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola ML5 UNW41221.1    
 H4J00_18445 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola ML5 UNW42223.1    
 ACU12_11565   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola RS105 AKO16268.1    
 WMO32_12975   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola TanzP11-2L WYL83724.1    
 FE36_02665 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YM15 AKK62845.1    
 FE36_08500   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YM15 AKK63880.1    
 IYN96_11960   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YN01 ULX23202.1    
 IYN96_18240 (fragment)   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YN01 ULX24178.1    
 LL920_00615   Xanthomonas oryzae PXO112 WDN15711.1    
 LL919_07565   Xanthomonas oryzae PXO280 WDN13050.1    
 MJJ08_14645   Xanthomonas oryzae PXO339 WEE96575.1    
 LL924_15580   Xanthomonas oryzae PXO340 WDN18234.1    
 LL922_11130   Xanthomonas oryzae PXO341 WDN09412.1    
 LL921_08465   Xanthomonas oryzae PXO347 WDN05386.1    
 LL917_13075   Xanthomonas oryzae PXO349 WDM98980.1    
 LL927_20180   Xanthomonas oryzae PXO363 WDM96349.1    
 LL930_19505   Xanthomonas oryzae PXO79 WDN22373.1    
 KFK26_09435   Xanthomonas oryzae PXO99A-gx UEQ21307.1    
 EYR27_08665   Xanthomonas oryzae X11-5A QBG83952.1    
 LL926_10295   Xanthomonas oryzae Z173 WDN39070.1    
 XPE_09060   Xanthomonas perforans 91-118 AQS76430.1    
 PJW03_07465   Xanthomonas perforans GEV1001 WCC55954.1    
 PJW04_03410   Xanthomonas perforans GEV872 WCC50906.1    
 BJD13_13395   Xanthomonas perforans LH3 APO99954.1    
 FLG15_12125   Xanthomonas phaseoli pv. dieffenbachiae D182 QER94742.1    
 FLG15_03060   Xanthomonas phaseoli pv. dieffenbachiae D182 QER93235.1    
 K9838_03520   Xanthomonas phaseoli pv. manihotis CHN01 UEQ15767.1    
 J6335_03425   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli 6546R(delta)tal18H QTK95899.1    
 J6335_10390   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli 6546R(delta)tal18H QTK97081.1    
 OM954_12635   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BB007a UZB23244.1    
 OM954_03490   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BB007a UZB25536.1    
 OM952_03495   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BB013a UZB12935.1    
 OM952_12195   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BB013a UZB10650.1    
 OM949_03450   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BB075a UZB17094.1    
 OM949_12010   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BB075a UZB14838.1    
 OM951_01145   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BRA241 UZB29282.1    
 OM951_07565   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli BRA241 UZB30355.1    
 OM947_03460   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli CFBP 7423 UZB21241.1    
 OM947_12210   Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli CFBP 7423 UZB18999.1    
Top


Last update: 2024-04-25 © Copyright 1998-2024
AFMB - CNRS - Université d'Aix-Marseille