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Polysaccharide Lyase Family 8

Activities in FamilyExo-β-1,4-glucuronan lyase (EC 4.2.2.-);
Exo-hyaluronate lyase (EC 4.2.2.-);
Hyaluronate lyase (EC 4.2.2.1);
Xanthan lyase (EC 4.2.2.12);
Chondroitinase B (EC 4.2.2.19);
Poly(β-mannuronate) lyase / M-specific alginate lyase (EC 4.2.2.3);
Chondroitin AC lyase (EC 4.2.2.5);
Heparin lyase / heparin lyase I (EC 4.2.2.7);
Mechanism b-elimination
3D Structure Status( α / α ) 6 toroid + anti-parallel β-sheet
Commercial Enzyme Provider(s)MEGAZYME; PROZOMIX;
Statistics GenBank accession (4807); Uniprot accession (30); PDB accession (54); 3D entries (13); cryst (1)
Summary
Download PL8 (5166) Taxonomic display Structure (13 - 1 cryst) Characterized (33)
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Eukaryota
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D Subf
 246267   Pycnoporus puniceus CIRM-BRFM 1868 v1.0 (Pycpun1)       4
 456587   Pycnoporus puniceus CIRM-BRFM 1868 v1.0 (Pycpun1)       4
 1592999   Pycnoporus sanguineus BRFM1264 v1 (Pycsa1)       4
 1676925   Pycnoporus sanguineus BRFM1264 v1 (Pycsa1)       4
 285311   Ramaria rubella (R. acris) UT-36052-T v1 (Ramac1)       4
 RhiXN_09231   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW20256.1     4
 RhiXN_08709   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW23673.1     4
 RhiXN_08748   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW23712.1     4
 RhiXN_04827   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW16825.1     4
 RhiXN_08698   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW23662.1     4
 RhiXN_01019   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW19613.1     4
 RhiXN_08749   Rhizoctonia solani AG-1 IA QRW23713.1     4
 7910   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 7915   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 12691   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 3656   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 11734   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 11179   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 11180   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 7921   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 2136   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 12689   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 13680   Rhizoctonia solani AG-1 IB (Rhiso1)       4
 11390   Rhizoctonia solani AG-3 Rhs1AP (Rhisol1)       4
 8606   Rhizoctonia solani AG-3 Rhs1AP (Rhisol1)       4
 1636   Rhizoctonia solani AG-3 Rhs1AP (Rhisol1)       4
 12048   Rhizoctonia solani AG-8 WAC10335 (Rhisola1)      
 13744   Rhizoctonia solani AG-8 WAC10335 (Rhisola1)       4
 5746   Rhizoctonia solani AG-8 WAC10335 (Rhisola1)       4
 4533   Rhizoctonia solani AG-8 WAC10335 (Rhisola1)       4
 12056   Rhizoctonia solani AG-8 WAC10335 (Rhisola1)       4
 7414   Rhizopogon vesiculosus Smith (Rhives1)       4
 680685   Rhizopogon vinicolor AM-OR11-026 v1 (Rhivi1)       4
 15622   Rhizopus microsporus var. chinensis CCTCC M201021 (Rhich1)       4
 231987   Rhizopus microsporus var. microsporus ATCC52813 v1.0 (Rhimi1_1)       4
 291190   Rhizopus microsporus var. microsporus ATCC52814 v1.0 (Rhimi_ATCC52814_1)       4
 2700931   Rickenella fibula HBK330-10 v1.0 (Ricfib1)       4
 924017   Rigidoporus microporus ED310 (Rigmic1)       4
 979204   Russula brevipes BPL707 v1.0 (Rusbre1)       4
 1120914   Russula dissimulans BPL704 v1.0 (Rusdis1)       4
 1277121   Russula earlei BPL698 v1.0 (Rusear1)       4
 1373005   Russula earlei BPL698 v1.0 (Rusear1)       4
 1288820   Russula earlei BPL698 v1.0 (Rusear1)       4
 738018   Russula ochroleuca Prilba v1.0 (Rusoch1)       4
 1111824   Russula rugulosa BPL654 v1.0 (Rusrug1)       4
 35257   Russula vinacea BPL710 v1.0 (Rusvin1)       4
 117   Saksenaea vasiformis B4078 (Sakvas1)       4
 6403   Saksenaea vasiformis B4078 (Sakvas1)       4
 2628008   Schizophyllum commune H4-8 v3.0 (Schco3)       4
 186197   Schizophyllum commune Loenen D v1 (Schco_LoeD_1)       4
 314619   Schizophyllum commune Tattone D v1 (Schco_TatD_1)       4
 842659   Schizopora paradoxa KUC8140 v1 (Schpa1)       4
 41867   Serpula lacrymans var shastensis SHA21-2 v1 (Serla_varsha1)       4
 42086   Serpula lacrymans var shastensis SHA21-2 v1 (Serla_varsha1)       4
 96760   Serpula lacrymans var. lacrymans S7.3 v2 (SerlaS7_3_2)       4
 114809   Serpula lacrymans var. lacrymans S7.3 v2 (SerlaS7_3_2)       4
 47482   Sphaerobolus stellatus SS14 (Sphst1)       4
 234866   Sphaerobolus stellatus SS14 (Sphst1)       4
 1993313   Spinellus fusiger NRRL 22323 v1.0 (Spifus1)       4
 525807   Sporodiniella umbellata MES 1446 v1.0 (Spoumb1)       4
 polysaccharide lyase family 8 protein (AmdS)   Stereum hirsutum JSJ_JEGJ_X18 WWU01847.1     4
 1023841   Suillus americanus EM31 v1.0 (Suiame1)       4
 988736   Suillus americanus EM31 v1.0 (Suiame1)       4
 951772   Suillus ampliporus FC55 v1.0 (Suiamp1)       4
 794485   Suillus ampliporus FC55 v1.0 (Suiamp1)       4
 1113724   Suillus bovinus UH-Sbo-P2 v1.0 (Suibov1)       4
 26337   Suillus bovinus UH-Sbo-P2 v1.0 (Suibov1)       4
 722680   Suillus brevipes Sb2 v2.0 (Suibr2)       4
 723939   Suillus brevipes Sb2 v2.0 (Suibr2)       4
 1773331   Suillus subluteus FC464 v1.0 (Suisubl1)       4
 1568730   Suillus subluteus FC464 v1.0 (Suisubl1)       4
 491374   Suillus clintonianus FC179 v1.0 (Suicli1)       4
 868413   Suillus clintonianus FC179 v1.0 (Suicli1)       4
 1409534   Suillus cothurnatus VC 1858 v1.0 (Suicot1)       4
 1625875   Suillus cothurnatus VC 1858 v1.0 (Suicot1)       4
 13400   Suillus discolor FC423 v1.0 (Suidis1)       4
 691710   Suillus discolor FC423 v1.0 (Suidis1)       4
 937959   Suillus fuscotomentosus FC203 v1.0 (Suifus1)       4
 1234528   Suillus fuscotomentosus FC203 v1.0 (Suifus1)       4
 1891277   Suillus lakei FC43 v1.0 (Suilak1)       4
 1891631   Suillus lakei FC43 v1.0 (Suilak1)       4
 2846382   Suillus luteus UH-Slu-Lm8-n1 v3.0 (Suilu4)       4
 2892939   Suillus luteus UH-Slu-Lm8-n1 v3.0 (Suilu4)       4
 771056   Suillus occidentalis FC124 v1.0 (Suiocc1)       4
 918952   Suillus occidentalis FC124 v1.0 (Suiocc1)       4
 597432   Suillus occidentalis FC124 v1.0 (Suiocc1)       4
 1108708   Suillus paluster FC165 v1.0 (Suipal1)       4
 1277781   Suillus paluster FC165 v1.0 (Suipal1)       4
 969768   Suillus placidus DOB743 v1.0 (Suipla1)       4
 1175881   Suillus placidus DOB743 v1.0 (Suipla1)       4
 1317476   Suillus plorans S12 v1.0 (Suiplo1)       4
 1438602   Suillus plorans S12 v1.0 (Suiplo1)       4
 1449289   Suillus pictus EM44 v1.0 (Suipic1)       4
 9566   Suillus pictus EM44 v1.0 (Suipic1)       4
 772902   Suillus subalutaceus FC151 v1.0 (Suisu1)       4
 166935   Suillus subalutaceus FC151 v1.0 (Suisu1)       4
 1258453   Suillus subaureus MN1 v1.0 (Suisub1)       4
 1474915   Suillus subaureus MN1 v1.0 (Suisub1)       4
 744388   Suillus tomentosus FC115 v1.0 (Suitom1)       4
 693270   Suillus tomentosus FC115 v1.0 (Suitom1)       4
 494860   Suillus variegatus UH-Sva-Z1 v1.0 (Suivar1)       4
 1468880   Suillus variegatus UH-Sva-Z1 v1.0 (Suivar1)       4
 382312   Thamnidium elegans v1.0 (Thaele1)       4
 440777   Thamnidium elegans v1.0 (Thaele1)       4
 632160   Thanatephorus cucumeris PT424 v1.0 (Thacu1)       4
 697574   Thanatephorus cucumeris PT424 v1.0 (Thacu1)       4
 579581   Thanatephorus cucumeris PT424 v1.0 (Thacu1)       4
 579680   Thanatephorus cucumeris PT424 v1.0 (Thacu1)       4
 199327   Tolypocladium inflatum NRRL 8044 (Tolinf1)       4
 6620   Tolypocladium ophioglossoides CBS100239 (Tolop1)       4
 5886   Tolypocladium paradoxum NRBC 100945 (Tolpa1)       4
 736635   Trametes betulina CIRM-BRFM 1801 (Trabet1)       4
 878005   Trametes betulina CIRM-BRFM 1801 (Trabet1)       4
 1439752   Trametes gibbosa CIRM-BRFM 1770 v1.0 (Tragib1)       4
 1321238   Trametes gibbosa CIRM-BRFM 1770 v1.0 (Tragib1)       4
 954711   Trametes ljubarskyi (Tralj1)       4
 954671   Trametes ljubarskyi (Tralj1)       4
 976090   Trametes maxima CIRM-BRFM 1813 v1.0 (Tramax1)       4
 154638   Trametes maxima CIRM-BRFM 1813 v1.0 (Tramax1)       4
 997101   Trametes meyenii CIRM-BRFM 1810 (Tramey1)       4
 898593   Trametes meyenii CIRM-BRFM 1810 (Tramey1)       4
 1044586   Trametes polyzona CIRM-BRFM 1798 (Trapol1)       4
 1213950   Trametes polyzona CIRM-BRFM 1798 (Trapol1)       4
 159259   Trametes versicolor FP-101664 SS1 (Trave1)       4
 111754   Trametes versicolor FP-101664 SS1 (Trave1)       4
 7517   Trichoderma arundinaceum IBT 40837 (Triaru1)       4
 164054   Trichoderma asperelloides T203 v1.0 (Triasper1)       4
 150343   Trichoderma asperellum TR356 v1.0 (Triasp1)       4
 TrA_006726   Trichoderma asperellum FT101 UKZ91754.1     4
 88099   Trichoderma atrobrunneum ITEM 908 (Triatrob1)       4
 TrAtP1_003003   Trichoderma atroviride P1 UKZ61744.1     4
 318424   Trichoderma atroviride v2.0 (Triat2)       4
 121733   Trichoderma brevicompactum IBT40841 (Tribre1)       4
 1141611   Trichoderma citrinoviride v4 (Trici4)       4
 6278   Trichoderma gamsii T6085 (Trigam1)       4
 496   Trichoderma guizhouense NJAU 4742 (Trigui1)       4
 355924   Trichoderma harzianum TR274 v1.0 (Trihar1)       4
 1338994   Trichoderma longibrachiatum ATCC 18648 v3 (Trilo3)       4
 exo-β-1,4-glucuronan lyase (TpPL8A; A9Z42_0065330) 4.2.2.- Trichoderma parareesei OTA05836.1 A0A2H2ZV03   4
 1512   Trichoderma parareesei CBS 125925 (Tripar1)       4
 115086   Trichoderma pleuroti TPhu1 (Triple1)       4
 2416   Trichoderma reesei CBS999.97 MAT1-1 (TrireMAT11_1)       4
 2411   Trichoderma reesei CBS999.97 MAT1-2 (TrireMAT12_1)       4
 110924   Trichoderma reesei QM6a (Trire_Chr)       4
 12151   Trichoderma reesei RUT C-30 v1 (TrireRUTC30_1)       4
 111245   Trichoderma reesei (Trire2)       4
 H0G86_012215   Trichoderma simmonsii GH-Sj1 QYT05319.1     4
 TrVFT333_010949   Trichoderma virens FT-333 UKZ83144.1     4
 TrVGV298_011287   Trichoderma virens Gv29-8 UKZ57430.1     4
 217585   Trichoderma virens Gv29-8 v2.0 (TriviGv29_8_2)       4
 929817   Tricholoma matsutake v3 (Trima3)       4
 1379292   Tricholoma matsutake v3 (Trima3)      
 251625   Trichosporon oleaginosus IBC0246 v1 (Triol1)       4
 355553   Umbelopsis sp. nov. AD052 v1.0 (Umbsp_AD052_1)      
 261008   Umbelopsis sp. nov. AD052 v1.0 (Umbsp_AD052_1)       4
 LOC62_02G002677 (Csla_0)   Vanrija pseudolonga WOO79140.1     4
 LOC62_03G003869 (Csla_1)   Vanrija pseudolonga WOO80352.1     4
 55966   Vararia minispora EC-137 v1.0 (Varmin1)       4
 85101   Vararia minispora EC-137 v1.0 (Varmin1)       4
 42162   Vararia minispora EC-137 v1.0 (Varmin1)       4
 113180   Volvariella volvacea V23 (Volvo1)       4
 119668   Volvariella volvacea V23 (Volvo1)       4
 113177   Volvariella volvacea V23 (Volvo1)       4
 113174   Volvariella volvacea V23 (Volvo1)       4
 112753   Volvariella volvacea V23 (Volvo1)       4
Viruses
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D Subf
 polysaccharide lyase   Acanthamoeba castellanii medusavirus stheno QPB44198.1    
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