Home Enzyme Classes Associated Modules Genomes Functional Data Download CAZy
 




Carbohydrate-Binding Module Family 50

Activities in FamilyModules of approx. 50 residues found attached to various enzymes from families GH18, GH19, GH23, GH24, GH25 and GH73, i.e. enzymes cleaving either chitin or peptidoglycan. Binding to chitopentaose demonstrated in the case of Pteris ryukyuensis chitinase A [Ohnuma T et al. (2008) J. Biol. Chem. 283:5178-87 (PMID: 18083709)]. CBM50 modules are also found in a multitude of other enzymes targeting the petidoglycan such as peptidases and amidases. These enzymes are not reported in the list below.
NoteAlso known as LysM domains
External resourcesCAZypedia;
Statistics GenBank accession (122948); Uniprot accession (16); PDB accession (42); 3D entries (29); cryst (0)
Summary
Download CBM50 (190629) Taxonomic display Structure (29)
| 1 | ... | 1719 | 1720 | 1721 | 1722 | 1723 | 1724 | 1725 | 1726 | 1727 | ... | 1747 |
Bacteria
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D
 ATY42_15950   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO71 AOS03334.1    
 ATY42_14340   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO71 AOS04655.1    
 ATY42_04845   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO71 AOS01487.1    
 ATY42_02710   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO71 AOS01133.1    
 APZ20_20700   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO83 ALZ73532.1    
 APZ20_18210   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO83 ALZ73135.1    
 APZ20_08590   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO83 ALZ74057.1    
 APZ20_07020   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO83 ALZ71285.1    
 AZ54_09225   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 AJQ82771.1    
 AZ54_07505   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 AJQ82488.1    
 AZ54_19395   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 AJQ84495.1    
 AZ54_22070   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 AJQ84949.1    
 PXO_04054   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD57329.1    
 PXO_04252 (LysM)   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD57556.1    
 PXO_00162   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD58305.1    
 PXO_01256   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD60125.1    
 PXO_02472   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A ACD60762.1    
 LA08_15305   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AXN23186.1    
 LA08_20625   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AXN22486.1    
 LA08_16965   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AXN21964.1
AZK84346.1		    
 LA08_05215   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AXN20282.1
AZK82526.1		    
 LA08_02990   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AXN19961.1
AZK82188.1		    
 BO992_14605   Xanthomonas oryzae pv. oryzae ScYc-b AZK85661.1    
 BXU03_03035   Xanthomonas oryzae pv. oryzae SK2-3 AXQ74006.1    
 BXU03_19355   Xanthomonas oryzae pv. oryzae SK2-3 AXQ76436.1    
 BXU03_07355   Xanthomonas oryzae pv. oryzae SK2-3 AXQ74654.1    
 BXU03_09035   Xanthomonas oryzae pv. oryzae SK2-3 AXQ77339.1    
 EBA15_08025   Xanthomonas oryzae pv. oryzae T19 QBN78966.1    
 EBA15_05395   Xanthomonas oryzae pv. oryzae T19 QBN78591.1    
 EBA15_09260   Xanthomonas oryzae pv. oryzae T19 QBN79158.1    
 EBA15_02495   Xanthomonas oryzae pv. oryzae T19 QBN78180.1    
 EBA16_02490   Xanthomonas oryzae pv. oryzae Ug11 QBN81823.1    
 EBA16_09255   Xanthomonas oryzae pv. oryzae Ug11 QBN82802.1    
 EBA16_08020   Xanthomonas oryzae pv. oryzae Ug11 QBN82610.1    
 EBA16_05390   Xanthomonas oryzae pv. oryzae Ug11 QBN82233.1    
 ABM06_02720   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XF89b AQU44072.1    
 ABM06_14560   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XF89b AQU47646.1    
 ABM06_16170   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XF89b AQU46285.1    
 ABM06_04805   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XF89b AQU44408.1    
 B4599_15125   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XM9 AXX69420.1    
 B4599_02925   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XM9 AXX66075.1    
 B4599_05185   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XM9 AXX66415.1    
 B4599_16825   Xanthomonas oryzae pv. oryzae XM9 AXX68153.1    
 BRN66_16805   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YC11 AXM18018.1    
 BRN66_05225   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YC11 AXM16378.1    
 BRN66_15100   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YC11 AXM19266.1    
 BRN66_20590   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YC11 AXM18552.1    
 BRN66_02990   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YC11 AXM16058.1    
 BO993_22650   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YN24 AZK89831.1    
 BO993_04800   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YN24 AZK86539.1    
 BO993_00735   Xanthomonas oryzae pv. oryzae YN24 AZK85919.1    
 GHV42_09270   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola 0-9 QGH65858.1    
 GHV42_02515   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola 0-9 QGH64803.1    
 ACU13_02460   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola B8-12 AKN92089.1    
 ACU13_08625   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola B8-12 AKN93089.1    
 XOC_4135   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 AEQ98213.1    
 XOC_2965   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 AEQ97065.1    
 XOC_1141   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 AEQ95332.1    
 XOC_2785   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 AEQ96892.1    
 ACU10_08570   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS279 AKN98952.1    
 ACU10_02460   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS279 AKN95829.1    
 ACU15_08445   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BXOR1 AKO00533.1    
 ACU15_02465   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BXOR1 AKN99562.1    
 ACU11_19225   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP2286 AKO21258.1    
 ACU11_12585   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP2286 AKO20167.1    
 ACU16_19095   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7331 AKO05892.1    
 ACU16_05795   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7331 AKO03739.1    
 ACU16_09090   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7331 AKO06508.1    
 ACU17_05630   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7341 AKO07626.1    
 ACU17_08940   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7341 AKO10424.1    
 ACU17_02835   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7341 AKO07185.1    
 BE73_13495   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 AJQ87958.1    
 BE73_18750   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 AJQ88856.1    
 BE73_02545   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 AJQ86121.1    
 V1208_08355   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GD06 WVN07931.1    
 V1208_19405   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GD06 WVN06303.1    
 XOCgx_0598   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 QEO95592.1    
 XOCgx_2071   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 QEO97063.1    
 K2I41_02850   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 UBB93534.1    
 K2I41_09335   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX01 UBB94522.1    
 HED68_09045   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX2019 WGY42490.1    
 HED68_02545   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola GX2019 WGY41501.1    
 ACU14_02445   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola L8 AKO11052.1    
 ACU14_08580   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola L8 AKO12042.1    
 WMO35_18315   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola MD-Ivory-1-B WYL77345.1    
 WMO35_18300   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola MD-Ivory-1-B WYL77342.1    
 WMO35_02570   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola MD-Ivory-1-B WYL78146.1    
 WMO35_12585   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola MD-Ivory-1-B WYL76452.1    
 H4J00_02550   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola ML5 UNW43035.1    
 H4J00_09065   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola ML5 UNW44051.1    
 H4J00_18465   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola ML5 UNW42226.1    
 H4J00_18480   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola ML5 UNW42229.1    
 ACU12_02450   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola RS105 AKO14785.1    
 ACU12_08605   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola RS105 AKO15781.1    
 WMO32_19500   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola TanzP11-2L WYL84750.1    
 FE36_04575   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YM15 AKK63174.1    
 FE36_17445   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YM15 AKK65455.1    
 FE36_11435   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YM15 AKK64396.1    
 IYN96_18275   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YN01 ULX24183.1    
 IYN96_02540   Xanthomonas oryzae pv. oryzicola YN01 ULX24967.1    
Top


Last update: 2024-04-25 © Copyright 1998-2024
AFMB - CNRS - Université d'Aix-Marseille