Carbohydrate-Binding Module Family 50

Activities in FamilyModules of approx. 50 residues found attached to various enzymes from families GH18, GH19, GH23, GH24, GH25 and GH73, i.e. enzymes cleaving either chitin or peptidoglycan. Binding to chitopentaose demonstrated in the case of Pteris ryukyuensis chitinase A [Ohnuma T et al. (2008) J. Biol. Chem. 283:5178-87 (PMID: 18083709)]. CBM50 modules are also found in a multitude of other enzymes targeting the petidoglycan such as peptidases and amidases. These enzymes are not reported in the list below.
NoteAlso known as LysM domains
External resourcesCAZypedia;
Statistics GenBank accession (122948); Uniprot accession (16); PDB accession (42); 3D entries (29); cryst (0)
| 1 | ... | 1718 | 1719 | 1720 | 1721 | 1722 | 1723 | 1724 | 1725 | 1726 | ... | 1747 |
Bacteria
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D
 BVV09_05750   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI129 AUJ08197.1    
 BVV20_02605   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI134 AUJ11409.1    
 BVV20_08400   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI134 AUJ14486.1    
 BVV20_09350   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI134 AUJ12370.1    
 BVV13_02540   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI145 AUJ15143.1    
 BVV13_08390   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI145 AUJ18186.1    
 BVV13_09335   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI145 AUJ16102.1    
 BVV13_05750   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI145 AUJ15607.1    
 BVV16_05740   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI68 AUI89831.1    
 BVV16_02540   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI68 AUI89368.1    
 BVV16_08380   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI68 AUI92412.1    
 BVV16_09325   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI68 AUI90329.1    
 BVV17_09335   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI73 AUI94005.1    
 BVV17_02540   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI73 AUI93045.1    
 BVV17_05750   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI73 AUI93510.1    
 BVV17_08390   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI73 AUI96088.1    
 BVV18_02545   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI95 AUI96716.1    
 BVV18_09340   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI95 AUI97674.1    
 BVV18_05760   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI95 AUI97181.1    
 BVV18_08395   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI95 AUI99761.1    
 BVV10_05755   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI99 AUJ00853.1    
 BVV10_08400   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI99 AUJ03439.1    
 BVV10_02545   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI99 AUJ00387.1    
 BVV10_09345   Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAI99 AUJ01350.1    
 EBA21_05515   Xanthomonas oryzae pv. oryzae NX0260 QBO01579.1    
 EBA21_22265   Xanthomonas oryzae pv. oryzae NX0260 QBO03923.1    
 EBA21_06900   Xanthomonas oryzae pv. oryzae NX0260 QBO04373.1    
 EBA21_13065   Xanthomonas oryzae pv. oryzae NX0260 QBO02633.1    
 BRN32_03055   Xanthomonas oryzae pv. oryzae OS198 AXM12346.1    
 BRN32_21025   Xanthomonas oryzae pv. oryzae OS198 AXM14809.1    
 BRN32_15590   Xanthomonas oryzae pv. oryzae OS198 AXM15517.1    
 BRN32_05305   Xanthomonas oryzae pv. oryzae OS198 AXM12661.1    
 BRN32_17265   Xanthomonas oryzae pv. oryzae OS198 AXM14302.1    
 BRN51_20195   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX079 AXM41218.1    
 BRN51_08470   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX079 AXM41983.1    
 BRN51_03370   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX079 AXM38868.1    
 BRN51_04485   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX079 AXM39016.1    
 BRN51_16805   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX079 AXM40763.1    
 BRN52_07525   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX086 AXM31787.1    
 BRN52_19540   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX086 AXM33484.1    
 BRN52_09220   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX086 AXM34348.1    
 BRN52_22255   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PX086 AXM33871.1    
 DZA55_01050   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO142 QBA13393.1    
 DZA55_16785   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO142 QBA15561.1    
 DZA55_19120   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO142 QBA15889.1    
 DZA55_04810   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO142 QBA13913.1    
 DZA55_06510   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO142 QBA16742.1    
 ATY43_10615   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO145 AOS08717.1    
 ATY43_12250   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO145 AOS06714.1    
 ATY43_19030   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO145 AOS07763.1    
 ATY43_21605   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO145 AOS08158.1    
 ATY44_18365   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO211 AOS11941.1    
 ATY44_07070   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO211 AOS10110.1    
 ATY44_08645   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO211 AOS12874.1    
 ATY44_20870   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO211 AOS12340.1    
 ATY45_18030   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO236 AOS16116.1    
 ATY45_06860   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO236 AOS14278.1    
 ATY45_08405   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO236 AOS17040.1    
 ATY45_20495   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO236 AOS16511.1    
 ATY46_02715   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO282 AOS17741.1    
 ATY46_14660   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO282 AOS21285.1    
 ATY46_04845   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO282 AOS18090.1    
 ATY46_16245   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO282 AOS19976.1    
 EBA22_16990   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO364 QBO07047.1    
 EBA22_15320   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO364 QBO08273.1    
 EBA22_20790   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO364 QBO07585.1    
 EBA22_03010   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO364 QBO05055.1    
 EBA22_05325   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO364 QBO05393.1    
 EBA23_17000   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO404 QBO10820.1    
 EBA23_15325   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO404 QBO12064.1    
 EBA23_03010   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO404 QBO08838.1    
 EBA23_20805   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO404 QBO11356.1    
 EBA23_05320   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO404 QBO09173.1    
 EBA24_20780   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO421 QBO15134.1    
 EBA24_05320   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO421 QBO12965.1    
 EBA24_03015   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO421 QBO12628.1    
 EBA24_16985   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO421 QBO14605.1    
 EBA24_15315   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO421 QBO15842.1    
 EBA25_05315   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO513 QBO16750.1    
 EBA25_15340   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO513 QBO19645.1    
 EBA25_17010   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO513 QBO18408.1    
 EBA25_03010   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO513 QBO16417.1    
 ATY47_16175   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO524 AOS24133.1    
 ATY47_02735   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO524 AOS21891.1    
 ATY47_14590   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO524 AOS25451.1    
 ATY47_04880   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO524 AOS22246.1    
 ATY48_16100   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO563 AOS28292.1    
 ATY48_14445   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO563 AOS29630.1    
 ATY48_02700   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO563 AOS26063.1    
 ATY48_04845   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO563 AOS26416.1    
 ATY49_04875   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO602 AOS30585.1    
 ATY49_14410   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO602 AOS33770.1    
 ATY49_02745   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO602 AOS30231.1    
 ATY49_16010   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO602 AOS32431.1    
 B9W05_11420   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK19284.1
AXI18432.1
AXI22405.1
QBO22251.1
   
 B9W05_23775   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK21067.1
AXI20652.1
QBO20546.1
   
 B9W05_09740   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK21297.1    
 B9W05_15090   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK19821.1
AXI18959.1
AXI22945.1
QBO22778.1
   
 B9W05_21520   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AWK20727.1
AXI20302.1
QBO20211.1
   
 CDO19_06645   Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO61 AXI23691.1
AXI19558.1
QBO23489.1
   
Top


Last update: 2024-04-25 © Copyright 1998-2024
AFMB - CNRS - Université d'Aix-Marseille