Glycoside Hydrolase Family 13 / Subf 13

Activities in Sub Family[retaining] pullulanase (EC 3.2.1.41);
Isoamylase (EC 3.2.1.68);
Mechanism Retaining a
ClanGH-H
3D Structure Status( β / α ) 8 barrel
Catalytic Nucleophile/BaseAsp (experimental)
Catalytic Proton DonorGlu (experimental)
NoteNew: many members have been assigned to subfamilies as described by Stam et al. (2006) Protein Eng Des Sel. 19, 555-562 (PMID: 17085431)
External resourcesCAZypedia; EBI Protein of the Month; HOMSTRAD; PDB Molecule of the Month; PRINTS;
Commercial Enzyme Provider(s)MEGAZYME; PROZOMIX;
Statistics GenBank accession (16); Uniprot accession (17); PDB accession (30); 3D entries (5); cryst (0)
| 1 | ... | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | ... | 31 |
Bacteria
Protein Name EC#Organism GenBankUniprotPDB/3DSubf
 OG925_35250 (PulA)   Streptomyces canus NBC_01585 WSD89219.1     13
 PYS65_26350 (PulA)   Streptomyces sp. HUAS 5 WGD43365.1     13
 CVT27_07770   Streptomyces cavourensis 1AS2a ATY95401.1     13
 NLU04_25445 (PulA)   Streptomyces cavourensis F2 UTR81584.1     13
 OUQ49_08270 (PulA)   Streptomyces cavourensis NA4 WAE65742.1     13
 DTW94_07930 (PulA)   Streptomyces cavourensis TJ430 AXI71244.1     13
 NRO40_25590 (PulA)   Streptomyces changanensis HL-66 UUS34998.1     13
 NRO40_07685 (PulA)   Streptomyces changanensis HL-66 UUS30723.1     13
 CP983_31125 (PulA)   Streptomyces chartreusis ATCC 14922 QEV70651.1     13
 HUT05_34580 (PulA)   Streptomyces chartreusis NA02069 QKZ22025.1     13
 IPT68_10520 (PulA)   Streptomyces chromofuscus DSM 40273 QOV46297.1     13
 CP977_10015 (PulA)   Streptomyces cinereoruber ATCC 19740 QEV32470.1     13
 STRCI_002449 (PulA)   Streptomyces cinnabarinus DSM 40467 WAZ21287.1     13
 CRV15_21150   Streptomyces clavuligerus ATCC 27064 QCS07897.1     13
 LL058_06920 (PulA)   Streptomyces clavuligerus DSM 738 WDN51606.1     13
 D1794_21785 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D-5 AXU15123.1     13
 I3J04_21205 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D1 QPL65124.1     13
 I3J07_21255 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D10 QPL83262.1     13
 I3J08_06835 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D14 QPL86900.1     13
 I3J09_21220 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D18 QPM01234.1     13
 I3J15_21145 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D25 QPL95345.1     13
 I3J16_21230 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D26 QPM07249.1     13
 I3J19_21205 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D28 QPM25545.1     13
 I3J17_06860 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D31 QPM10766.1     13
 I3J18_21245 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D35 QPM19306.1     13
 I3J05_21215 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D4 QPL71155.1     13
 I3J06_21220 (PulA)   Streptomyces clavuligerus F1D7 QPL77238.1     13
 BB341_20930   Streptomyces clavuligerus F613-1 ANW20496.1     13
 SCO2226 or SC10B7.21c   Streptomyces coelicolor A3(2) CAB90874.1
NP_626477.1
    13
 FQ762_11360 (PulA)   Streptomyces coelicolor A3(2) CFB_NBC_0001 QFI42384.1     13
 JCM4020_23870   Streptomyces coelicolor JCM 4020 BDD71767.1     13
 HCU77_11000 (PulA)   Streptomyces coelicolor M1154/pAMX4/pGP1416 QKN66021.1     13
 RE436_11065 (PulA)   Streptomyces coelicolor M22 WMT32919.1     13
 CP976_12815 (PulA)   Streptomyces coeruleorubidus ATCC 13740 QEV24967.1     13
 PV963_12890 (PulA)   Streptomyces coeruleorubidus DM WDV51207.1     13
 R5U08_25790 (PulA)   Streptomyces coeruleorubidus WT-48 WOT37330.1     13
 RFN52_11125 (PulA)   Streptomyces collinus CGMCC 4.1623 WMX63881.1     13
 HGI09_47170 (PulA)   Streptomyces collinus L2 UJA17342.1     13
 HGI10_16930 (PulA)   Streptomyces collinus SQ UJA07792.1     13
 B446_11665   Streptomyces collinus Tu 365 AGS69155.1     13
 QU709_31630 (PulA)   Streptomyces coralus SX92 WLW55607.1     13
 EJ357_13050 (PulA)   Streptomyces cyaneochromogenes MK-45 AZQ34296.1     13
 R2B67_27410 (PulA)   Streptomyces cyaneofuscatus 89-2-2 WOP12040.1     13
 SJX93_08810 (PulA)   Streptomyces cyaneofuscatus NEB1061 WRO09715.1     13
 TU94_09620   Streptomyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus NMWT 1 AJP01729.1     13
 S1361_12225 (AmY)   Streptomyces cyanogenus S136 QTD98119.1     13
 N8I84_12285 (PulA)   Streptomyces cynarae HUAS 13-4 UXY19418.1     13
 BN159_6201   Streptomyces davaonensis JCM 4913 CCK30580.1     13
 L3078_13005 (PulA)   Streptomyces deccanensis KCTC 19241 ULR50154.1     13
 K7C20_10545 (PulA)   Streptomyces decoyicus NRRL 2666 QZY20459.1     13
 C4B68_29085   Streptomyces dengpaensis XZHG99 AVH61497.1     13
 NEH16_23000 (PulA)   Streptomyces drozdowiczii MDA8-470 UZK56568.1     13
 RI138_07495 (PulA)   Streptomyces durocortorensis C11-1 WNF26694.1     13
 OJ254_16955 (PulA)   Streptomyces endophytica HNM0140 UZJ31671.1     13
 PS783_11000 (PulA)   Streptomyces enissocaesilis NBF 715 WDI18073.1     13
 GFH48_28855 (PulA)   Streptomyces fagopyri QMT-28 QFZ76736.1     13
 IM697_10735 (PulA)   Streptomyces ferrugineus CCTCC AA2014009 QOV38802.1     13
 EIZ62_23965 (PulA)   Streptomyces ficellus NRRL 8067 QGV82830.1     13
 K7395_27410 (PulA)   Streptomyces filamentosus L30 USC50181.1     13
 F0344_27305 (PulA)   Streptomyces finlayi NBSH44 QNE79463.1     13
 J4032_27545 (PulA)   Streptomyces formicae 1H-GS9 UNM14716.1     13
 KY5_2221c   Streptomyces formicae KY5 ATL27239.1     13
 CP974_07610 (PulA)   Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 QEV11912.1     13
 RYQ63_07120 (PulA)   Streptomyces fradiae FIMYZ-003 WOI63646.1     13
 D3X13_02370 (PulA)   Streptomyces fradiae NKZ-259 AYA15255.1     13
 J5J01_15355 (PulA)   Streptomyces fradiae ZXY017 UQS28461.1     13
 IFE09_08705 (PulA)   Streptomyces fulvissimus DF QQZ53706.1     13
 HUT09_08615 (PulA)   Streptomyces fulvissimus NA06532 QKW42629.1     13
 CNQ36_09910   Streptomyces fungicidicus TXX3120 AYL35728.1     13
 CP966_10015 (PulA)   Streptomyces galilaeus ATCC 14969 QEU65580.1     13
 H4W23_11235 (PulA)   Streptomyces gardneri ATCC 15439 QPK45153.1     13
 IAG43_25260 (PulA)   Streptomyces genisteinicus CRPJ-33 QNP65910.1     13
 B1H19_13020   Streptomyces gilvosporeus F607 ARF55006.1     13
 SGLAU_10125   Streptomyces glaucescens GLA.O AIR98035.1     13
 WQO_08895   Streptomyces globisporus C-1027 ALU93464.1     13
 DIJ69_25395   Streptomyces globisporus TFH56 AWL88800.1     13
 C0216_24115   Streptomyces globosus LZH-48 AXE26134.1     13
 GCM10017557_59820   Streptomyces glomeroaurantiacus JCM 4677 BCL31123.1     13
 test1122_04485 (PulA)   Streptomyces gobiensis 1_25 UGY91051.1     13
 SGFS_083540   Streptomyces graminofaciens A-8890 BBC37060.1     13
 V9K83_23860 (PulA)   Streptomyces griseoaurantiacus XQ-29 WWY86995.1     13
 J3S04_21735 (PulA)   Streptomyces griseocarneus KCC S-1010 QSY47857.1     13
 AVL59_38155   Streptomyces griseochromogenes ATCC 14511 ANP54645.1     13
 HEP81_05552 (PulA)   Streptomyces griseofuscus DSM 40191 QNT95804.1     13
 UBV09_09350 (PulA)   Streptomyces griseoincarnatus HNS054 WPW18914.1     13
 DWG14_06099 (AmY)   Streptomyces griseorubiginosus 3E-1 AYC41808.1     13
 ELQ87_28230 (PulA)   Streptomyces griseoviridis F1-27 AZS87680.1     13
 DDJ31_11030   Streptomyces griseoviridis K61 QCN85472.1     13
 SGR_5281   Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350 BAG22110.1     13
 K9S39_31865 (PulA)   Streptomyces halobius 3_2 UQA95855.1     13
 CEB94_12045   Streptomyces hawaiiensis ATCC 12236 QCD55527.1     13
 DWB77_05490 (AmY)   Streptomyces hundungensis BH38 AYG83294.1     13
 HOK021_17930   Streptomyces hygroscopicus HOK021 BDH10614.1     13
 V8J11_00860 (PulA)   Streptomyces hygroscopicus subsp. hygroscopicus DSM 41954 WXA04395.1     13
 SHJG_3716   Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 AEY88988.1     13
 SHJGH_3481   Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 AGF63146.1     13
 SHL15_2266   Streptomyces hygroscopicus subsp. limoneus KCTC 1717 ALO93424.1     13
 SHXM_03762   Streptomyces hygroscopicus XM201 AQW50299.1     13
 RFN58_12325 (PulA)   Streptomyces iakyrus CGMCC 4.1912 WVG01837.1     13
 ABB07_27190   Streptomyces incarnatus NRRL 8089 AKJ13585.1     13
Top




Last update: 2024-04-25 © Copyright 1998-2024
AFMB - CNRS - Université d'Aix-Marseille