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Carbohydrate-Binding Module Family 50

Activities in FamilyModules of approx. 50 residues found attached to various enzymes from families GH18, GH19, GH23, GH24, GH25 and GH73, i.e. enzymes cleaving either chitin or peptidoglycan. Binding to chitopentaose demonstrated in the case of Pteris ryukyuensis chitinase A [Ohnuma T et al. (2008) J. Biol. Chem. 283:5178-87 (PMID: 18083709)]. CBM50 modules are also found in a multitude of other enzymes targeting the petidoglycan such as peptidases and amidases. These enzymes are not reported in the list below.
NoteAlso known as LysM domains
External resourcesCAZypedia;
Statistics GenBank accession (122948); Uniprot accession (16); PDB accession (42); 3D entries (29); cryst (0)
Summary
Download CBM50 (190629) Taxonomic display Structure (29)
| 1 | ... | 457 | 458 | 459 | 460 | 461 | 462 | 463 | 464 | 465 | ... | 1747 |
Bacteria
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D
 INQ83_01030   Chlamydia suis 4.1.4.2-3 QYC73687.1    
 INQ83_01940   Chlamydia suis 4.1.4.2-3 QYC73843.1    
 INQ83_01940   Chlamydia suis 4.1.4.2-3 QYC73843.1    
 INQ84_01990   Chlamydia suis 5.2.1.2-1 QYC74745.1    
 INQ84_01990   Chlamydia suis 5.2.1.2-1 QYC74745.1    
 INQ84_01030   Chlamydia suis 5.2.1.2-1 QYC74582.1    
 INQ85_01030   Chlamydia suis 5.2.1.2-2 QYC75491.1    
 INQ85_02025   Chlamydia suis 5.2.1.2-2 QYC75659.1    
 INQ85_02025   Chlamydia suis 5.2.1.2-2 QYC75659.1    
 INQ86_01025   Chlamydia suis 5.2.1.4-1 QYC76405.1    
 INQ86_01980   Chlamydia suis 5.2.1.4-1 QYC76570.1    
 INQ86_01980   Chlamydia suis 5.2.1.4-1 QYC76570.1    
 INQ87_01030   Chlamydia suis 5.2.1.4-2 QYC77317.1    
 INQ87_01935   Chlamydia suis 5.2.1.4-2 QYC77472.1    
 INQ87_01935   Chlamydia suis 5.2.1.4-2 QYC77472.1    
 INQ88_01030   Chlamydia suis 5.2.1.4-3 QYC78215.1    
 INQ88_01935   Chlamydia suis 5.2.1.4-3 QYC78370.1    
 INQ88_01935   Chlamydia suis 5.2.1.4-3 QYC78370.1    
 INQ89_01030   Chlamydia suis 6.2.2.1-1 QYC79125.1    
 INQ89_01990   Chlamydia suis 6.2.2.1-1 QYC79288.1    
 INQ89_01990   Chlamydia suis 6.2.2.1-1 QYC79288.1    
 INQ90_02010   Chlamydia suis 6.2.2.1-2 QYC80256.1    
 INQ90_02010   Chlamydia suis 6.2.2.1-2 QYC80256.1    
 INQ90_01035   Chlamydia suis 6.2.2.1-2 QYC80089.1    
 INQ91_01030   Chlamydia suis 6.2.2.1-3 QYC81055.1    
 INQ91_01950   Chlamydia suis 6.2.2.1-3 QYC81213.1    
 INQ91_01950   Chlamydia suis 6.2.2.1-3 QYC81213.1    
 INQ92_02025   Chlamydia suis 6.2.2.2-1 QYC82122.1    
 INQ92_02025   Chlamydia suis 6.2.2.2-1 QYC82122.1    
 INQ92_01110   Chlamydia suis 6.2.2.2-1 QYC81965.1    
 INQ93_01925   Chlamydia suis 6.2.2.2-2 QYC83029.1    
 INQ93_01925   Chlamydia suis 6.2.2.2-2 QYC83029.1    
 INQ93_01020   Chlamydia suis 6.2.2.2-2 QYC82873.1    
 INQ94_01020   Chlamydia suis 6.2.2.2-3 QYC83764.1    
 INQ94_01930   Chlamydia suis 6.2.2.2-3 QYC83921.1    
 INQ94_01930   Chlamydia suis 6.2.2.2-3 QYC83921.1    
 INQ95_01930   Chlamydia suis 6.2.2.4-1 QYC84815.1    
 INQ95_01930   Chlamydia suis 6.2.2.4-1 QYC84815.1    
 INQ95_01025   Chlamydia suis 6.2.2.4-1 QYC84659.1    
 INQ96_01020   Chlamydia suis 6.2.2.4-2 QYC85554.1    
 INQ96_02000   Chlamydia suis 6.2.2.4-2 QYC85721.1    
 INQ96_02000   Chlamydia suis 6.2.2.4-2 QYC85721.1    
 INQ97_01020   Chlamydia suis 6.2.2.4-3 QYC86457.1    
 INQ97_01925   Chlamydia suis 6.2.2.4-3 QYC86612.1    
 INQ97_01925   Chlamydia suis 6.2.2.4-3 QYC86612.1    
 INP50_01900   Chlamydia suis 94 Ry QYC90208.1    
 INP50_01900   Chlamydia suis 94 Ry QYC90208.1    
 INP50_01020   Chlamydia suis 94 Ry QYC90055.1    
 Chls_952   Chlamydia suis R19 QHP83827.1    
 Chls_161 (NlpD)   Chlamydia suis R19 QHP83036.1    
 Chls_161 (NlpD)   Chlamydia suis R19 QHP83036.1    
 IMZ92_01920   Chlamydia suis S45 RIF QYC89303.1    
 IMZ92_01920   Chlamydia suis S45 RIF QYC89303.1    
 IMZ92_01025   Chlamydia suis S45 RIF QYC89154.1    
 BW241_04675   Chlamydia trachomatis 434Bu ARZ54438.1    
 BW241_00735   Chlamydia trachomatis 434Bu ARZ53749.1    
 BW241_00735   Chlamydia trachomatis 434Bu ARZ53749.1    
 A363_00821   Chlamydia trachomatis A/363 CCP48157.1    
 A363_00821   Chlamydia trachomatis A/363 CCP48157.1    
 A363_00644   Chlamydia trachomatis A/363 CCP47997.1    
 A5291_00643   Chlamydia trachomatis A/5291 CCP48896.1    
 A5291_00820   Chlamydia trachomatis A/5291 CCP49056.1    
 A5291_00820   Chlamydia trachomatis A/5291 CCP49056.1    
 A7249_00642   Chlamydia trachomatis A/7249 CCP49794.1    
 A7249_00819   Chlamydia trachomatis A/7249 CCP49954.1    
 A7249_00819   Chlamydia trachomatis A/7249 CCP49954.1    
 CTO_0652   Chlamydia trachomatis A2497 AEP35473.1
CAX09271.1		    
 CTO_0829   Chlamydia trachomatis A2497 AEP35651.1
CAX09431.1		    
 CTO_0829   Chlamydia trachomatis A2497 AEP35651.1
CAX09431.1		    
 CTW3_03310   Chlamydia trachomatis C/TW-3 AHC17454.1    
 CTW3_04265   Chlamydia trachomatis C/TW-3 AHC17624.1    
 CTW3_04265   Chlamydia trachomatis C/TW-3 AHC17624.1    
 HRD58_03870   Chlamydia trachomatis CH1_mutant_L2/434/Bu(i) QKP16179.1    
 HRD58_03870   Chlamydia trachomatis CH1_mutant_L2/434/Bu(i) QKP16179.1    
 HRD58_02985   Chlamydia trachomatis CH1_mutant_L2/434/Bu(i) QKP16022.1    
 HRJ29_02985   Chlamydia trachomatis CH2_mutant_L2/434/Bu(i) QKP16925.1    
 HRJ29_03870   Chlamydia trachomatis CH2_mutant_L2/434/Bu(i) QKP17081.1    
 HRJ29_03870   Chlamydia trachomatis CH2_mutant_L2/434/Bu(i) QKP17081.1    
 HRJ30_00785   Chlamydia trachomatis CH3_mutant_L2/434/Bu(i) QKP14725.1    
 HRJ30_01670   Chlamydia trachomatis CH3_mutant_L2/434/Bu(i) QKP14882.1    
 HRJ30_01670   Chlamydia trachomatis CH3_mutant_L2/434/Bu(i) QKP14882.1    
 HRJ31_01670   Chlamydia trachomatis CH5_mutant_L2/434/Bu(i) QKP13980.1    
 HRJ31_01670   Chlamydia trachomatis CH5_mutant_L2/434/Bu(i) QKP13980.1    
 HRJ31_00785   Chlamydia trachomatis CH5_mutant_L2/434/Bu(i) QKP13824.1    
 CTDEC_0601 (PapQ)   Chlamydia trachomatis D-EC ADI51277.1    
 CTDLC_0601 (PapQ)   Chlamydia trachomatis D-LC ADI52289.1    
 O176_04245   Chlamydia trachomatis D/13-96 AGT69367.1    
 O176_04245   Chlamydia trachomatis D/13-96 AGT69367.1    
 O176_03290   Chlamydia trachomatis D/13-96 AGT69209.1    
 O177_03290   Chlamydia trachomatis D/14-96 AGT70133.1    
 O177_04235   Chlamydia trachomatis D/14-96 AGT70289.1    
 O177_04235   Chlamydia trachomatis D/14-96 AGT70289.1    
 DCS63711_03300   Chlamydia trachomatis D/CS637/11 AKR32768.1    
 DCS63711_04255   Chlamydia trachomatis D/CS637/11 AKR32938.1    
 DCS63711_04255   Chlamydia trachomatis D/CS637/11 AKR32938.1    
 SOTOND1_00814   Chlamydia trachomatis D/SotonD1 CCP52955.1    
 SOTOND1_00814   Chlamydia trachomatis D/SotonD1 CCP52955.1    
 SOTOND1_00637   Chlamydia trachomatis D/SotonD1 CCP52795.1    
 SOTOND5_00812   Chlamydia trachomatis D/SotonD5 CCP53847.1    
 SOTOND5_00812   Chlamydia trachomatis D/SotonD5 CCP53847.1    
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Last update: 2024-04-25 © Copyright 1998-2024
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