CAZy ~ Carbohydrate-Active enZymes


Welcome to the GlycosylTransferase family server

  Introduction
  Catalytic Mechanism
  Tables for Direct Access
  Note
  References
 
Introduction
 
 The biosynthesis of disaccharides, oligosaccharides and polysaccharides involves the action of hundreds of different glycosyltransferases (EC 2.4.x.y), enzymes which catalyse the transfer of sugar moieties from activated donor molecules to specific acceptor molecules, forming glycosidic bonds. Glycosyltransferases can be classified according to the stereochemistries of the reaction substrates and products as either retaining or inverting enzymes [1]. The recommendations of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) do not indicate the intrinsic structural features of the enzymes, nor do they adequately accommodate enzymes which act on several distinct substrates.

 The CAZy database proposes the continuously updated classification of glycosyltransferases using nucleotide diphospho-sugar, nucleotide monophospho-sugars and sugar phosphates (EC 2.4.1.x) and related proteins into distinct sequence-based families as first described by Campbell et al. [2] and developed by Coutinho et al. [3]. The same three-dimensional fold is expected to occur within each of the families. Just as for the glycoside hydrolases, several of the families defined on the basis of sequence similarities turn out to have similar three-dimensional structures.
 
Catalytic Mechanism
 
 By analogy with glycosidases, two main catalytic mechanisms can be envisioned for glycosyltransferases : inversion of the anomeric configuration (for instance UDP-glucose -> -glucoside) or retention of the anomeric configuration (for instance UDP-glucose -> -glucoside).
 
Inverting glycosyltransferases most likely follow a single displacement mechanism where the acceptor performs a nucleophilic attack at carbon C-1 of the sugar donor somewhat anologous to the mechanism of inverting glycosidases. On the other hand, retaining glycosyltransferases do not appear to operate via a two-step mechanism involving the formation of a glycosyl-enzyme intermediate analogous to glycosidases. Instead, an internal return SNi-like mechanism has been proposed in which leaving group departure and nucleophilic attack occur in a concerted but asynchronous manner on the same face of the glycoside [4].

 
Tables for Direct Access


Family Number 
 
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
 
31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60
 
61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90
 
91                                                          
 
* Non-Classified Sequences
 

EC Number 
 
 2.4.1.1 35                                                        
 
 2.4.1.11 3 5                                                      
 
 2.4.1.12 2                                                        
 
 2.4.1.13 4                                                        
 
 2.4.1.14 4                                                        
 
 2.4.1.15 20                                                        
 
 2.4.1.16 2                                                        
 
 2.4.1.17 1 2 70                                                    
 
 2.4.1.21 5                                                        
 
 2.4.1.22 7                                                        
 
 2.4.1.26 72                                                        
 
 2.4.1.27 63                                                        
 
 2.4.1.34 48                                                        
 
 2.4.1.37 6 77                                                      
 
 2.4.1.38 7                                                        
 
 2.4.1.40 6                                                        
 
 2.4.1.41 27                                                        
 
 2.4.1.44 8                                                        
 
 2.4.1.45 1                                                        
 
 2.4.1.46 28                                                        
 
 2.4.1.47 1                                                        
 
 2.4.1.52 4                                                        
 
 2.4.1.56 4 9                                                      
 
 2.4.1.57 4                                                        
 
 2.4.1.58 8                                                        
 
 2.4.1.65 10                                                        
 
 2.4.1.68 23                                                        
 
 2.4.1.69 2 11 37 74                                                  
 
 2.4.1.79 31                                                        
 
 2.4.1.80 21                                                        
 
 2.4.1.83 2                                                        
 
 2.4.1.87 6                                                        
 
 2.4.1.88 6                                                        
 
 2.4.1.90 7                                                        
 
 2.4.1.91 1                                                        
 
 2.4.1.92 12                                                        
 
 2.4.1.94 41                                                        
 
 2.4.1.101 13                                                        
 
 2.4.1.102 14                                                        
 
 2.4.1.109 39                                                        
 
 2.4.1.115 1                                                        
 
 2.4.1.117 2                                                        
 
 2.4.1.119 66                                                        
 
 2.4.1.120 1                                                        
 
 2.4.1.121 1                                                        
 
 2.4.1.122 31                                                        
 
 2.4.1.123 8                                                        
 
 2.4.1.128 1                                                        
 
 2.4.1.129 51                                                        
 
 2.4.1.130 58                                                        
 
 2.4.1.131 15                                                        
 
 2.4.1.132 4                                                        
 
 2.4.1.133 7                                                        
 
 2.4.1.135 43                                                        
 
 2.4.1.142 33                                                        
 
 2.4.1.143 16                                                        
 
 2.4.1.144 17                                                        
 
 2.4.1.145 54                                                        
 
 2.4.1.149 31                                                        
 
 2.4.1.150 14                                                        
 
 2.4.1.152 10                                                        
 
 2.4.1.155 18                                                        
 
 2.4.1.157 4 28                                                      
 
 2.4.1.159 1                                                        
 
 2.4.1.170 1                                                        
 
 2.4.1.173 1                                                        
 
 2.4.1.174 7                                                        
 
 2.4.1.175 2 7 31                                                    
 
 2.4.1.177 1                                                        
 
 2.4.1.182 19                                                        
 
 2.4.1.183 5                                                        
 
 2.4.1.186 8                                                        
 
 2.4.1.187 26                                                        
 
 2.4.1.194 1                                                        
 
 2.4.1.195 1                                                        
 
 2.4.1.198 4                                                        
 
 2.4.1.199 2                                                        
 
 2.4.1.203 1                                                        
 
 2.4.1.208 4                                                        
 
 2.4.1.210 1                                                        
 
 2.4.1.212 2                                                        
 
 2.4.1.213 20                                                        
 
 2.4.1.214 10                                                        
 
 2.4.1.215 1                                                        
 
 2.4.1.217 55                                                        
 
 2.4.1.221 65                                                        
 
 2.4.1.222 31                                                        
 
 2.4.1.223 47 64                                                      
 
 2.4.1.224 47 64                                                      
 
 2.4.1.225 47 64                                                      
 
 2.4.1.226 2 7 31                   &