Glycoside Hydrolase Family 50

Activities in Familyβ-agarase (EC 3.2.1.81).
Mechanism probably retaining
ClanGH-A
Catalytic Nucleophile/BaseGlu (inferred)
Catalytic Proton DonorGlu (inferred)
External resourcesCAZypedia;
Statistics GenBank accession (584); Uniprot accession (56); PDB accession (5); 3D entries (2); cryst (0)
All (565) Archaea (6) Bacteria (559) Structure (2) Characterized (23)
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
Bacteria
Protein Name EC#OrganismGenBank UniprotPDB/3D
 CSC27_3706   Pseudomonas aeruginosa AR_0440 AWF66053.1    
 CSC30_1425   Pseudomonas aeruginosa AR_0443 AWF62617.1    
 CSC33_3095   Pseudomonas aeruginosa AR_0446 AWQ81786.1    
 BGV84_20090   Pseudomonas aeruginosa ATCC 15692 AOP59397.1    
 A4W92_06395   Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 AMX86609.1    
 ACG06_21590   Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 ANT77828.1    
 G655_20055   Pseudomonas aeruginosa B136-33 AGI82926.1    
 A6R75_32250   Pseudomonas aeruginosa BAMC 07-48 ANA74627.1    
 M802_1079   Pseudomonas aeruginosa c7447m AGV67157.1    
 YQ19_24460   Pseudomonas aeruginosa Carb01 63 AKE71263.1    
 β-1,3-glucanase   Pseudomonas aeruginosa CAU 342A AST24418.1    
 CLH63_13035   Pseudomonas aeruginosa CCUG 70744 AWR43625.1    
 AOU28_00080   Pseudomonas aeruginosa Cu1510 ALS10080.1    
 DPADHS01_22790   Pseudomonas aeruginosa DHS01 AMA38786.1    
 PADK1_03993   Pseudomonas aeruginosa DK1 CRZ31538.1    
 PADK2_20455   Pseudomonas aeruginosa DK2 AFM66362.1    
 BG483_21275   Pseudomonas aeruginosa DN1 AON73644.1    
 PA50071_20145   Pseudomonas aeruginosa DSM 50071 = NBRC 12689 AKO88066.1    
 E613_45510   Pseudomonas aeruginosa E6130952 ARG88619.1    
 F22031_02505   Pseudomonas aeruginosa F22031 AJD59463.1    
 HW10_22805   Pseudomonas aeruginosa F23197 ALY37907.1
ALY37907.2
   
 HW09_10730   Pseudomonas aeruginosa F30658 ALY41364.1    
 HV91_22070   Pseudomonas aeruginosa F5677 AVE34728.1    
 HW08_03760   Pseudomonas aeruginosa F63912 ALY46487.2
ALY46487.1
   
 HW11_16675   Pseudomonas aeruginosa F9670 ALZ37996.1    
 ADJ52_06695   Pseudomonas aeruginosa F9676 AKQ14575.1    
 BHE76_02510   Pseudomonas aeruginosa FA-HZ1 AOT36207.1    
 HW06_26380   Pseudomonas aeruginosa H27930 ALY62541.1
ALY62541.2
   
 HW05_27285   Pseudomonas aeruginosa H47921 ALY68541.1    
 HW07_12290   Pseudomonas aeruginosa H5708 ALY54174.1
ALY54174.2
   
 IOMTU133_4556   Pseudomonas aeruginosa IOMTU 133 BAT67032.1    
 BMR72_20570   Pseudomonas aeruginosa isolate B10W APB66678.1    
 DCS61_16545   Pseudomonas aeruginosa K34-7 AWT30623.1    
 BWR11_21985   Pseudomonas aeruginosa L10 ASM86979.1    
 T222_22175   Pseudomonas aeruginosa LES400 AHK97028.1    
 T223_21845   Pseudomonas aeruginosa LES431 AHC66921.1    
 PLES_42771   Pseudomonas aeruginosa LESB58 CAW29032.1 B7UXE5  
 T224_21775   Pseudomonas aeruginosa LESB65 AHL02994.1    
 T225_21675   Pseudomonas aeruginosa LESlike1 AHL08915.1    
 T226_21730   Pseudomonas aeruginosa LESlike4 AHL14870.1    
 T227_21785   Pseudomonas aeruginosa LESlike5 AHK85150.1    
 T228_21460   Pseudomonas aeruginosa LESlike7 AHK91050.1    
 HW04_10615   Pseudomonas aeruginosa M1608 ALY71457.1    
 PAM18_3999   Pseudomonas aeruginosa M18 AEO76480.1    
 A6752_06135   Pseudomonas aeruginosa M28A1 ARN45323.1    
 HW03_26250   Pseudomonas aeruginosa M37351 ALY80183.1    
 A6746_20510   Pseudomonas aeruginosa M8A1 ARN36684.1    
 A6747_08165   Pseudomonas aeruginosa M8A4 ARN40037.1    
 C8257_22645   Pseudomonas aeruginosa MRSN12280 AVR84606.1    
 U769_20565   Pseudomonas aeruginosa MTB-1 AHB57351.1    
 AOY09_01922   Pseudomonas aeruginosa N15-01092 ALV76982.1    
 OB07_04061   Pseudomonas aeruginosa N17-1 AMU02394.1    
 NCGM1900_1563   Pseudomonas aeruginosa NCGM 1900 BAP20685.1    
 NCGM1984_4301   Pseudomonas aeruginosa NCGM 1984 BAP52263.1    
 NCGM2_1907   Pseudomonas aeruginosa NCGM2.S1 BAK88766.1    
 PA257_4776   Pseudomonas aeruginosa NCGM257 BAQ41362.1    
 ERS445055_04118   Pseudomonas aeruginosa NCTC10332 CKH94964.1    
 NCTC9433_04214   Pseudomonas aeruginosa NCTC9433 SQK99079.1    
 NHmuc_1500   Pseudomonas aeruginosa NHmuc APJ51537.1    
 CGU45_26560   Pseudomonas aeruginosa Ocean-1155 ASP14729.1    
 CGU46_19540   Pseudomonas aeruginosa Ocean-1175 ASP06973.1    
 PA1S_gp4645   Pseudomonas aeruginosa PA1 AHA20551.1    
 PA1088_04281 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA1088 AOX28396.1    
 PA1088_04280 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA1088 AOX28395.1    
 PA11803_02479 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA11803 AOX41370.1    
 PA11803_02480 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA11803 AOX41371.1    
 A9P90_05890   Pseudomonas aeruginosa PA121617 ANP58361.1    
 PA1R_gp4645   Pseudomonas aeruginosa PA1R AHA26350.1    
 AOD73_20720   Pseudomonas aeruginosa PA1RG ALE49830.1    
 BN889_01108   Pseudomonas aeruginosa PA38182 CDI89174.1    
 PA7790_03988 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA7790 APB58827.1    
 PA7790_03989 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA7790 APB58828.1    
 PA8281_02255 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA8281 AOX34769.1    
 PA8281_02254 (fragment)   Pseudomonas aeruginosa PA8281 AOX34768.1    
 PSA83_04385   Pseudomonas aeruginosa PA83 ASJ86577.1    
 PA96_4022   Pseudomonas aeruginosa PA96 AHW72503.1    
 AQ622_04208   Pseudomonas aeruginosa PAER4_119 APC74293.1    
 Y880_0413   Pseudomonas aeruginosa PAK ARI00473.1    
 PA1046   Pseudomonas aeruginosa PAO1 AAG04435.1
NP_249737.1
Q9I4S8  
 N297_1082   Pseudomonas aeruginosa PAO1-VE13 AGY71442.1    
 N296_1082   Pseudomonas aeruginosa PAO1-VE2 AGY65830.1    
 OU9_01059   Pseudomonas aeruginosa PAO1H2O AID72273.1    
 PAO1OR3957   Pseudomonas aeruginosa PAO1_Orsay CTQ38851.1    
 M801_1082   Pseudomonas aeruginosa PAO581 AGV58446.1    
 B7W86_22860   Pseudomonas aeruginosa PASGNDM345 ARI92978.1    
 B7W87_22865   Pseudomonas aeruginosa PASGNDM699 ARI99417.1    
 AXW93_20485   Pseudomonas aeruginosa PA_154197 ARC81176.1    
 AM599_21065   Pseudomonas aeruginosa PA_D1 AON08369.1    
 A6695_21140   Pseudomonas aeruginosa PA_D16 AON32360.1    
 A6681_21145   Pseudomonas aeruginosa PA_D2 AON14381.1    
 A7329_21130   Pseudomonas aeruginosa PA_D21 AON38363.1    
 A6701_21120   Pseudomonas aeruginosa PA_D22 AON44329.1    
 A6704_21135   Pseudomonas aeruginosa PA_D25 AON50350.1    
 A7331_21090   Pseudomonas aeruginosa PA_D5 AON20349.1    
 A6688_05265   Pseudomonas aeruginosa PA_D9 AON23332.1    
 A6748_11270   Pseudomonas aeruginosa Pb18 ARN52061.1    
 CWI21_22480   Pseudomonas aeruginosa PB350 AUA78769.1    
 CWI23_21565   Pseudomonas aeruginosa PB353 AUA90953.1    
 CWI22_21520   Pseudomonas aeruginosa PB354 AUA84862.1    
 CWI20_22480   Pseudomonas aeruginosa PB367 AUB03400.1    
Top


Last update: 2018-07-09 © Copyright 1998-2018
AFMB - CNRS - Université d'Aix-Marseille